More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0267 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
256 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
269 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 
266 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
263 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
258 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.68 
 
 
270 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
259 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
264 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
263 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
265 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
258 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
258 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.19 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.23 
 
 
275 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
260 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
253 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
260 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
261 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 
253 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.8 
 
 
257 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
260 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.94 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
256 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
260 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  40.23 
 
 
261 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
260 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
255 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
258 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  39.6 
 
 
657 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.94 
 
 
260 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
266 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
267 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
261 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.2 
 
 
257 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
249 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.01 
 
 
260 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
259 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
262 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  40.16 
 
 
283 aa  168  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  39.85 
 
 
261 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  39.85 
 
 
261 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
258 aa  168  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
261 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
259 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 
257 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
267 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
267 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
260 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
261 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
257 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  39.13 
 
 
663 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
258 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
261 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
257 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
260 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.23 
 
 
662 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.45 
 
 
662 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.8 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
257 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  38.76 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.91 
 
 
662 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
254 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.87 
 
 
261 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
260 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>