219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4260 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  78.26 
 
 
441 aa  716  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  100 
 
 
441 aa  909  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  36.53 
 
 
434 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.43 
 
 
414 aa  115  2e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30.55 
 
 
403 aa  111  2e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.62 
 
 
399 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  28.3 
 
 
399 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 
400 aa  109  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
390 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 
400 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  27.65 
 
 
395 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  34.67 
 
 
400 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.57 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  36.55 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.35 
 
 
402 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.45 
 
 
402 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  7.41696e-11 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
779 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  26.62 
 
 
580 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  32.07 
 
 
779 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.84 
 
 
780 aa  85.1  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
439 aa  84.7  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.57 
 
 
865 aa  84.7  3e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  84.3  4e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
440 aa  80.9  4e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 
875 aa  79  2e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  31.93 
 
 
360 aa  79  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
360 aa  76.6  9e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  28.86 
 
 
360 aa  75.5  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  35.9 
 
 
704 aa  74.7  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 
359 aa  74.3  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  39.29 
 
 
1676 aa  73.6  6e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  33.33 
 
 
631 aa  71.6  2e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 
359 aa  72.4  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36938e-08 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.1 
 
 
653 aa  70.1  7e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.26 
 
 
447 aa  69.7  1e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
270 aa  67.4  5e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  26.63 
 
 
370 aa  65.9  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
661 aa  66.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
267 aa  65.1  2e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
268 aa  65.1  2e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  28.9 
 
 
441 aa  62.4  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  28.9 
 
 
441 aa  62.4  2e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.64 
 
 
274 aa  59.7  1e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
210 aa  58.5  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  34.58 
 
 
268 aa  56.6  8e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.67391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.6657e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.29495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.53459e-05  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.91412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.63 
 
 
261 aa  56.2  1e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
276 aa  55.1  3e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  34.31 
 
 
249 aa  53.9  6e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
215 aa  53.1  9e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.65 
 
 
233 aa  52.8  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
225 aa  51.6  3e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
285 aa  51.6  3e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
272 aa  51.2  4e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 
234 aa  51.2  4e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
187 aa  51.2  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  31.86 
 
 
258 aa  50.8  5e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
344 aa  50.4  6e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
266 aa  50.4  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
268 aa  50.1  7e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  32.74 
 
 
267 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  32.74 
 
 
267 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  32.74 
 
 
267 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  32.74 
 
 
267 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  32.74 
 
 
267 aa  50.1  8e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.08 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  31.37 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.09 
 
 
287 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.98 
 
 
234 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.60433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 
251 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  33.03 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
241 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
241 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  35.05 
 
 
223 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.07 
 
 
251 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
254 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
275 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
278 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.32 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  31.86 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  32.14 
 
 
271 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  31.86 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  31.86 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  29.46 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  36.45 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.72 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>