More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1057 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  51.15 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  53.38 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  53.38 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  49.4 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  50.31 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  49.04 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  58.47 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  53.72 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  46.99 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  53.91 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  53.33 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  46.88 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  46.39 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  46.67 
 
 		 169 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.99 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  43.75 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  45.18 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  43.75 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  44.38 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.71 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  46.43 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  42.37 
 
 		 167 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  52.08 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  54.78 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  49.56 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  44.31 
 
 		 169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  47.62 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  48.39 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  41.32 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  46.11 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  44.62 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  51.26 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  50 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  49.58 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  49.11 
 
 		 159 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  49.58 
 
 		 137 aa  104  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  41.77 
 
 		 159 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  48.28 
 
 		 154 aa  104  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  43.97 
 
 		 158 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  40.35 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  46.22 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  49.57 
 
 		 168 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  46.22 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  47.41 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  46.34 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  50 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  48.28 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.55 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.41 
 
 		 255 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  41.22 
 
 		 157 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  49.12 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  42.52 
 
 		 155 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  50 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  47.41 
 
 		 157 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  38.37 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  42.47 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  44.9 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.41 
 
 		 270 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  45.04 
 
 		 154 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.21 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.41 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  49.11 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  45.71 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  41.21 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  42.59 
 
 		 154 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  42.14 
 
 		 159 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  47.37 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  49.11 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  45.54 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.22 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  52.99 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  38.85 
 
 		 156 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  42.22 
 
 		 157 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  48.09 
 
 		 157 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  38.79 
 
 		 160 aa  95.5  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.92 
 
 		 261 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.92 
 
 		 261 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  29.3 
 
 		 154 aa  94.4  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  53.04 
 
 		 157 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  46.49 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  42.03 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36.88 
 
 		 446 aa  93.2  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  53.04 
 
 		 157 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  38.22 
 
 		 301 aa  92  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  40.15 
 
 		 152 aa  92  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  40.15 
 
 		 152 aa  92  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  49.14 
 
 		 153 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>