More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  100 
 
 
279 aa  543  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  41.02 
 
 
286 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.25 
 
 
292 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.55 
 
 
280 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.84 
 
 
309 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.84 
 
 
281 aa  135  1e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
292 aa  134  1e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.44 
 
 
281 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.44 
 
 
281 aa  133  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.44 
 
 
281 aa  133  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.44 
 
 
281 aa  133  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.56 
 
 
294 aa  133  4e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.44 
 
 
281 aa  133  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.2 
 
 
310 aa  128  1e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.2 
 
 
310 aa  127  2e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.12 
 
 
316 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.85 
 
 
325 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.46 
 
 
314 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.39 
 
 
310 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.39 
 
 
310 aa  121  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.39 
 
 
310 aa  121  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.75 
 
 
305 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.41 
 
 
242 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
409 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
409 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
409 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
485 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
342 aa  83.2  4e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
337 aa  83.6  4e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  51.04 
 
 
337 aa  83.2  4e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
550 aa  83.2  4e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
331 aa  83.2  4e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  51.04 
 
 
331 aa  83.2  4e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  48.96 
 
 
336 aa  80.9  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  28.73 
 
 
314 aa  80.5  3e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
311 aa  79.3  7e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
291 aa  78.2  1e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 
273 aa  76.6  4e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.16038e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.79 
 
 
297 aa  76.6  4e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
332 aa  75.5  9e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  40 
 
 
386 aa  74.3  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
440 aa  74.3  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
290 aa  74.3  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 
291 aa  74.3  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
290 aa  74.3  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 
290 aa  73.9  3e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
290 aa  73.9  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 
296 aa  73.2  5e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  40.74 
 
 
294 aa  73.2  5e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 
278 aa  72.8  6e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
290 aa  72.8  6e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 
185 aa  72.8  6e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 
290 aa  72.4  7e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
293 aa  72  9e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 
513 aa  71.6  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  26.37 
 
 
306 aa  71.6  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 
409 aa  71.6  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.49 
 
 
298 aa  71.6  1e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
409 aa  71.6  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  29.56 
 
 
310 aa  71.2  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.63 
 
 
530 aa  71.2  2e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 
301 aa  71.2  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.94716e-07  hitchhiker  6.11237e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
290 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 
319 aa  70.9  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 
463 aa  71.2  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0009  helix-turn-helix- domain containing protein  33.01 
 
 
315 aa  70.9  2e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
288 aa  70.5  3e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
548 aa  70.5  3e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 
408 aa  70.1  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  3.5636e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 
408 aa  70.5  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
295 aa  70.1  4e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3826  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
307 aa  70.1  4e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.753921  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 
290 aa  70.1  4e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  31.31 
 
 
283 aa  70.1  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  31.31 
 
 
283 aa  70.1  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
313 aa  70.1  4e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  31.31 
 
 
283 aa  70.1  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
319 aa  70.1  4e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 
287 aa  70.1  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  31.31 
 
 
283 aa  70.1  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
313 aa  69.7  5e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 
766 aa  69.7  5e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 
290 aa  69.7  5e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 
296 aa  69.7  5e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 
271 aa  69.7  5e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 
409 aa  69.7  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 
409 aa  69.7  5e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 
412 aa  69.7  6e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 
324 aa  69.3  7e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
323 aa  69.3  7e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
288 aa  68.9  8e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
288 aa  68.9  8e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 
322 aa  68.9  8e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  26.83 
 
 
250 aa  68.9  8e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.41 
 
 
250 aa  68.9  8e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>