More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 
551 aa  1073  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  51.73 
 
 
527 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39928e-14 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.88 
 
 
539 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  50.88 
 
 
505 aa  416  1e-115  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.53 
 
 
517 aa  399  1e-110  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  51.04 
 
 
517 aa  400  1e-110  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  52.01 
 
 
476 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  50.75 
 
 
452 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.8 
 
 
484 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  51.59 
 
 
493 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.12 
 
 
465 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  51.72 
 
 
471 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  52.79 
 
 
489 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  52.77 
 
 
478 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  51.5 
 
 
509 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  50.31 
 
 
515 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  56.86 
 
 
480 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  50.1 
 
 
486 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  49.18 
 
 
543 aa  369  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  49.59 
 
 
455 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.59 
 
 
455 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.59 
 
 
455 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.65 
 
 
462 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.89 
 
 
449 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.1 
 
 
472 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  48.84 
 
 
494 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  49.36 
 
 
457 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  50.97 
 
 
502 aa  349  7e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.16 
 
 
509 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  49.78 
 
 
460 aa  345  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.42 
 
 
508 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.49 
 
 
440 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.22 
 
 
495 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.83 
 
 
532 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  45.74 
 
 
491 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  46.38 
 
 
460 aa  277  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.03 
 
 
452 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.09 
 
 
455 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.61 
 
 
462 aa  201  4e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35 
 
 
446 aa  199  1e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.9 
 
 
452 aa  198  2e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.28 
 
 
453 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.22 
 
 
449 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  34.81 
 
 
457 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.14 
 
 
452 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.6 
 
 
444 aa  191  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.66 
 
 
448 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  27.54 
 
 
447 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  31.26 
 
 
449 aa  173  8e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.48 
 
 
451 aa  173  8e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.55 
 
 
440 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.05 
 
 
452 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  29.89 
 
 
448 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.71 
 
 
448 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.27 
 
 
424 aa  170  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  28.36 
 
 
444 aa  170  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.69 
 
 
456 aa  169  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.79 
 
 
443 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.68 
 
 
448 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  25.89 
 
 
435 aa  166  1e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.12 
 
 
451 aa  166  1e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.48 
 
 
449 aa  164  5e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  28.6 
 
 
444 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  33.4 
 
 
501 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  28.6 
 
 
444 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  28.6 
 
 
444 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  28.6 
 
 
444 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  28.6 
 
 
444 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.4 
 
 
453 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  27.66 
 
 
444 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.09 
 
 
444 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  27.7 
 
 
444 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.78 
 
 
443 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  29.62 
 
 
462 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28 
 
 
438 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  33.83 
 
 
439 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  28.03 
 
 
444 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  27.87 
 
 
444 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.21 
 
 
444 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  34.5 
 
 
455 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  26.95 
 
 
446 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  29.46 
 
 
442 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  28.12 
 
 
451 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  28.6 
 
 
431 aa  153  6e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.13 
 
 
435 aa  153  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.13 
 
 
435 aa  153  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  24.68 
 
 
442 aa  153  9e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  30.63 
 
 
473 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  34.09 
 
 
455 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.71 
 
 
451 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  31.29 
 
 
447 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  24.26 
 
 
442 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  34.75 
 
 
455 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  29.75 
 
 
431 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  30.9 
 
 
432 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  28.74 
 
 
436 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  26.45 
 
 
440 aa  146  7e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  26.1 
 
 
452 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  34.47 
 
 
434 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  30.49 
 
 
451 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>