236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3219 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  95.91 
 
 		 391 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 391 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  98.97 
 
 		 391 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  94.88 
 
 		 391 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  98.97 
 
 		 391 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  43.15 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  43.15 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  42.89 
 
 		 391 aa  333  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  40.26 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  40.26 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  46.13 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  46.13 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  36.44 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  36.44 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  36.44 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  36.17 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  41.27 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.21 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.86 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.97 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.01 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 336 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  29.8 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.28 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.81 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.46 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.67 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.98 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.69 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.39 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.22 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.39 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.39 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.39 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.73 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.7 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.75 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.15 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.31 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.74 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.55 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.88 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.92 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.61 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.13 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  29.5 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.54 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.4 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.02 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  26.87 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  25.81 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.35 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  28.11 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  28.11 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  27.78 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>