More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1422 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  96.52 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  87.66 
 
 		 312 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  87.66 
 
 		 312 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  87.66 
 
 		 312 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  88.61 
 
 		 311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  89.56 
 
 		 319 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  67.44 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  58.05 
 
 		 308 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  52.48 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  51 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  52.81 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  52.85 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  52.06 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  51.01 
 
 		 302 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  51.01 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  50.67 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  50.67 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  50.37 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.73 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  36.45 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  34.54 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.89 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.24 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  34.56 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  34.5 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.07 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.52 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.31 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.74 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.05 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  33.65 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.67 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.97 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.05 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.05 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.05 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.5 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  36.6 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  31 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.59 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  29.84 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  30.45 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.33 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.07 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.74 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  33.75 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.65 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.33 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.68 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.69 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.41 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.25 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  30.13 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  31.5 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  31.29 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.49 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.59 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.12 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.38 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.42 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.75 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.05 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  31.19 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.1 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  32.08 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.77 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.12 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>