More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0903 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  95.58 
 
 		 477 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  100 
 
 		 431 aa  860    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  94.2 
 
 		 431 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  83.6 
 
 		 433 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  91.61 
 
 		 431 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  91.61 
 
 		 431 aa  798    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  94.43 
 
 		 431 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  74.25 
 
 		 435 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  91.61 
 
 		 431 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  91.61 
 
 		 446 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  91.84 
 
 		 431 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  85.45 
 
 		 433 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  95.13 
 
 		 431 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  91.61 
 
 		 431 aa  798    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  91.38 
 
 		 431 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  86.49 
 
 		 433 aa  757    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  91.61 
 
 		 431 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  73.38 
 
 		 429 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  94.43 
 
 		 488 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  99.54 
 
 		 431 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  73.81 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  73.22 
 
 		 433 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  72.09 
 
 		 437 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  73.38 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  70.95 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  67.84 
 
 		 439 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  72.2 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.88 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  69.19 
 
 		 454 aa  581  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  68.13 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.56 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.4 
 
 		 431 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  65.56 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  66.67 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.32 
 
 		 431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.95 
 
 		 438 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  71.97 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  66.75 
 
 		 477 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  72.47 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  63.55 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  64.24 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  66.83 
 
 		 437 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.64 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.42 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  63.93 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.4 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  66.02 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.86 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  64.03 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.11 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  64.03 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.76 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  61.67 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  62.26 
 
 		 440 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  61.67 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  61.67 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  61.67 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  61.67 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  62.47 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  57.48 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  58.33 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  60.34 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  60.93 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  58.88 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  56.56 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 425 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 425 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 425 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 		 438 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 438 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 427 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.12 
 
 		 430 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.24 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.19 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  41.94 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.38 
 
 		 440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 447 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  41.27 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 443 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>