160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0777 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  77.58 
 
 
788 aa  1163    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  100 
 
 
777 aa  1545    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  44.17 
 
 
610 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  44.24 
 
 
610 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  44.24 
 
 
610 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  44.24 
 
 
610 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  43.23 
 
 
611 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.38 
 
 
534 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
577 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
577 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  41.04 
 
 
577 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  41.07 
 
 
582 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  40.86 
 
 
577 aa  331  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  41.11 
 
 
694 aa  331  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  40.89 
 
 
562 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  40.89 
 
 
562 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  40 
 
 
562 aa  328  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  39.81 
 
 
579 aa  325  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.89 
 
 
579 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  40.89 
 
 
579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  40.22 
 
 
633 aa  317  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  40.22 
 
 
633 aa  317  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  40.57 
 
 
633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  40.57 
 
 
628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  40.39 
 
 
633 aa  313  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  40.22 
 
 
633 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  40.22 
 
 
633 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  40.18 
 
 
644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  38.95 
 
 
669 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  39.13 
 
 
766 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  39.13 
 
 
766 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  39.13 
 
 
766 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  39.13 
 
 
766 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  39.13 
 
 
798 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  38.95 
 
 
644 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  38.95 
 
 
766 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  32.33 
 
 
534 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  29.51 
 
 
539 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  31.54 
 
 
507 aa  159  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  31.55 
 
 
553 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  29.5 
 
 
529 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
529 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  29.55 
 
 
529 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 
1271 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.16 
 
 
529 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.16 
 
 
529 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  29.71 
 
 
529 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  29.92 
 
 
519 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  43.89 
 
 
298 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  43.89 
 
 
298 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  43.89 
 
 
298 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  29.33 
 
 
533 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  29.52 
 
 
529 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  29.83 
 
 
577 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  29.33 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  29.33 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
374 aa  137  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  30.59 
 
 
519 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  30.29 
 
 
540 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.97 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  29.89 
 
 
622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  39.91 
 
 
226 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  27.76 
 
 
1308 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  30.69 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  29.41 
 
 
540 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  29.9 
 
 
545 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.42 
 
 
403 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.97 
 
 
403 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.03 
 
 
405 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  40.32 
 
 
404 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  28.41 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  39.92 
 
 
410 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  25.26 
 
 
672 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
403 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
403 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  26.33 
 
 
626 aa  121  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  37.34 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  35.24 
 
 
406 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  37.34 
 
 
406 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  37.34 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  37.34 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  37.34 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  37.34 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  37.34 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
1267 aa  115  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  29.46 
 
 
1027 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.06 
 
 
1073 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  32.68 
 
 
553 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  29.65 
 
 
534 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  25.42 
 
 
976 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  46.72 
 
 
152 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  29.13 
 
 
523 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  39.32 
 
 
797 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  34.69 
 
 
511 aa  104  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.76 
 
 
1251 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  26.67 
 
 
626 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  28.39 
 
 
1317 aa  103  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  25.95 
 
 
1207 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  33.33 
 
 
413 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>