130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0272 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  99.12 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  78.51 
 
 		 228 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  60.93 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  60.93 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  56.68 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  50.23 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  49.55 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  47.39 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  46.52 
 
 		 288 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  47.96 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  50.43 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  50.43 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  45.22 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  42.99 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  49.55 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  47.58 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  45.58 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  43.32 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  44.19 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  42.4 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  42.4 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  41.99 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  41.4 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  42.15 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  41.23 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  42.27 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  40.83 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  38.25 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  39.37 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  29.13 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  29.38 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.58 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  31.84 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.36 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.18 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  31 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  30.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  30.38 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  29.79 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  28.87 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.57 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  29.13 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  33.91 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  28.37 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  30.08 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  30.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.26 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  27.15 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  27.9 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  31 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  29.96 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  29.96 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  26.77 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  27.95 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  30.34 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.52 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  30.09 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  30.26 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  30.8 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  30.8 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  21.15 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  30.8 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  31.7 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  28.88 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  28.81 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  25.96 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  28.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  26.55 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.44 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  27.71 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.38 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  30.32 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  31.49 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  30.9 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  21.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  29 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  29.58 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  29.58 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  30.87 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.22 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  26.54 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  29.58 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  24.22 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>