More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2752 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
591 aa  640  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
590 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
590 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
590 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  59.69 
 
 
586 aa  704  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
617 aa  763  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
593 aa  652  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  75.66 
 
 
604 aa  962  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1238  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  79.09 
 
 
599 aa  989  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1238  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
592 aa  688  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
598 aa  658  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1238  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
583 aa  668  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1238  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 
600 aa  1236  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
592 aa  703  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
595 aa  637  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  77.8 
 
 
603 aa  988  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  80.94 
 
 
605 aa  1022  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
590 aa  702  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
591 aa  706  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 
607 aa  646  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
591 aa  642  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.91465e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
613 aa  648  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  96.83 
 
 
600 aa  1205  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  73.36 
 
 
599 aa  906  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  58.4 
 
 
592 aa  701  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  1.15872e-07 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
591 aa  688  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
594 aa  648  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.45437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  78.48 
 
 
604 aa  998  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
610 aa  651  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 
599 aa  754  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 
590 aa  704  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
592 aa  694  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
590 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 
591 aa  702  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 
596 aa  759  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
600 aa  645  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
585 aa  647  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
590 aa  701  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
592 aa  704  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
598 aa  705  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
590 aa  703  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
590 aa  703  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 
591 aa  768  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
598 aa  704  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
595 aa  686  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.63507e-05  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
590 aa  703  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
591 aa  771  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  96.33 
 
 
600 aa  1201  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
592 aa  699  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.67018e-05  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
590 aa  692  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.2582e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
598 aa  704  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 
597 aa  647  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
597 aa  693  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
593 aa  697  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
595 aa  683  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  96.83 
 
 
600 aa  1206  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  58.4 
 
 
592 aa  701  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.41226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 
590 aa  703  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  91.67 
 
 
599 aa  1143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
591 aa  769  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  58.4 
 
 
592 aa  701  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
590 aa  704  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 
623 aa  1080  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  80.3 
 
 
599 aa  998  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
588 aa  645  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 
591 aa  726  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.82007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
593 aa  664  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
590 aa  761  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 
590 aa  751  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  78.38 
 
 
598 aa  987  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  80.64 
 
 
600 aa  1005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 
601 aa  743  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.25703e-08  unclonable  1.15783e-09 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  96.83 
 
 
600 aa  1206  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 
591 aa  775  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  93.8 
 
 
599 aa  1166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
590 aa  701  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
591 aa  759  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  2.71682e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
608 aa  734  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  1.20939e-10  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  73.69 
 
 
599 aa  910  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.13965e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
608 aa  637  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.16393e-05  hitchhiker  1.31011e-08 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
598 aa  663  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  82.64 
 
 
602 aa  1037  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 
597 aa  852  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
593 aa  659  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
598 aa  1234  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
595 aa  760  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 
591 aa  766  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
596 aa  675  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0223e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  96.67 
 
 
600 aa  1203  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 
598 aa  711  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
610 aa  689  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  9.68757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
594 aa  649  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12068e-12  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
606 aa  649  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
593 aa  713  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
593 aa  711  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>