More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0099 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0325  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0099  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1101  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 323 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 323 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 323 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  98.92 
 
 		 323 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1142  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2065  LysR family transcriptional regulator  74.45 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1130  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  73.36 
 
 		 318 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 318 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 318 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  72.36 
 
 		 320 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  72.36 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3898  LysR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2032  LysR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 302 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2070  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2847  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109493  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 317 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4670  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 317 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  hitchhiker  0.00186288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1244  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0599  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  28.64 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  27.23 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  24.46 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0286  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.794567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.58 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  20.37 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0894  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  21.51 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>