More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1306 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
330 aa  670  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
330 aa  670  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
330 aa  670  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  99.39 
 
 
332 aa  666  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
330 aa  670  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
330 aa  670  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  99.39 
 
 
330 aa  667  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  97.58 
 
 
330 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  93.92 
 
 
331 aa  560  1e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  9.45867e-06  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  93.92 
 
 
331 aa  560  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  2.23454e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  89.7 
 
 
330 aa  560  1e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  89.39 
 
 
330 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  93.62 
 
 
331 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  4.78477e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  93.62 
 
 
331 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.00591e-08  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  93.62 
 
 
331 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.78178e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  93.31 
 
 
331 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.84392e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  87.88 
 
 
330 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  94.03 
 
 
331 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  6.73013e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  70.81 
 
 
322 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  4.62084e-05  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  70.09 
 
 
325 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  70.72 
 
 
325 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  70.09 
 
 
325 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  68.85 
 
 
325 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  61.08 
 
 
334 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  60.67 
 
 
343 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  60.38 
 
 
313 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  60.18 
 
 
334 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  61.8 
 
 
341 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  59.09 
 
 
330 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.12 
 
 
322 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  58.88 
 
 
322 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.07661e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  58.65 
 
 
322 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  61.61 
 
 
359 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  58.54 
 
 
327 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  60.06 
 
 
322 aa  353  3e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  57.86 
 
 
342 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.13 
 
 
345 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  55.31 
 
 
345 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  56.41 
 
 
333 aa  345  9e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.46804e-07  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  54.98 
 
 
323 aa  345  9e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-05  decreased coverage  5.00836e-06 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  61.4 
 
 
327 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  53.99 
 
 
331 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  56.09 
 
 
324 aa  342  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.42 
 
 
322 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  53.94 
 
 
323 aa  341  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.25438e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  53.38 
 
 
348 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.55591e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  54.35 
 
 
327 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  54.81 
 
 
323 aa  340  3e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  54.84 
 
 
323 aa  339  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.12724e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  53.85 
 
 
323 aa  336  3e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  53.37 
 
 
331 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.87704e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  53.37 
 
 
331 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.09131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  53.37 
 
 
331 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.53104e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  53.37 
 
 
331 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.03675e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  53.21 
 
 
323 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.38852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  53.21 
 
 
323 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.53501e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  53.21 
 
 
323 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.94297e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 
323 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.84066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  56.41 
 
 
321 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  51.44 
 
 
326 aa  332  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.22684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  53.38 
 
 
322 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  59.93 
 
 
327 aa  332  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  53.38 
 
 
322 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  56.63 
 
 
327 aa  331  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
370 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
370 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
370 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
370 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  53.53 
 
 
323 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
370 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  5.67296e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  51.44 
 
 
323 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  53.05 
 
 
322 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  59.08 
 
 
344 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
323 aa  327  1e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  7.77945e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.73 
 
 
322 aa  327  1e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.5877e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.47788e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.96752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  327  2e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  51.77 
 
 
323 aa  327  2e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  326  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.24786e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  57.61 
 
 
327 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  326  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.39544e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  326  4e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.59787e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  56.77 
 
 
325 aa  326  4e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
323 aa  326  4e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  8.13107e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
323 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.29591e-06  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  52.73 
 
 
322 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  52.73 
 
 
322 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  50.8 
 
 
323 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.0929e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  51.13 
 
 
323 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.72444e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  51.13 
 
 
323 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  4.11512e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  52.73 
 
 
322 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  50 
 
 
322 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  53.87 
 
 
322 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  55.63 
 
 
331 aa  321  1e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.73118e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  53.38 
 
 
322 aa  320  2e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  55.31 
 
 
323 aa  320  2e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>