More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0149 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  84.48 
 
 		 276 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  74.9 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  69.55 
 
 		 261 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  48.92 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  51.38 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  49.8 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  48.62 
 
 		 288 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  46.64 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  50.39 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  49.22 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  49.61 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  45.85 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  45.85 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  48.99 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  48.99 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  47.84 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  49.03 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  46.64 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  44.31 
 
 		 272 aa  230  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  49.39 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  47.06 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  48.99 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  47.62 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  48.02 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  49.38 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  46.69 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  45.77 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  47.73 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  51.01 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  44.44 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  44.98 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  41.99 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  46.83 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  47.33 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  44.93 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  45.45 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  47.43 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  45.96 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  46.4 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  45.91 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  45.06 
 
 		 342 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  45.28 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  44.49 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  42.86 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.02 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  41.42 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.91 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  41.33 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  44.44 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  48.77 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  43.55 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.66 
 
 		 175 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  47.95 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  42.08 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  39.18 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.56 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  56.92 
 
 		 147 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  43.18 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  42.25 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  43.32 
 
 		 263 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  40.28 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  42.66 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  41.28 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.33 
 
 		 229 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  38.05 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  38.12 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  37.18 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  37.56 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  37.78 
 
 		 241 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  37.56 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  36.79 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  37.07 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  38.26 
 
 		 220 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  36.79 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  36.79 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  36.79 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  36.79 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  39.91 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  36.79 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  40.85 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  36.32 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  38.81 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  38.5 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  36.32 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  37.56 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  36.9 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  34.29 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.05 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.63 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  35.85 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>