More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1743 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 273 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.88 
 
 		 278 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.74 
 
 		 301 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.11 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.74 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.13 
 
 		 281 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  70.52 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.96 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  56 
 
 		 276 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.56 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.41 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.23 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.51 
 
 		 276 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.77 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.58 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.54 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.28 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.16 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.81 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.63 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.09 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.67 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.92 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.56 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.09 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.77 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 		 280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 289 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.42 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  40.29 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.39 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.28 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.54 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.99 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.8 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  41.04 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.04 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.96 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.56 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.62 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.53 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.32 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.92 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.63 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>