167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2614 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  67.08 
 
 
161 aa  211  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.94 
 
 
143 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.94 
 
 
143 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  67.13 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.33 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.7 
 
 
138 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  67.13 
 
 
143 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.37 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.26 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.26 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.25 
 
 
153 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.25 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.25 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.61 
 
 
154 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.61 
 
 
154 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.97 
 
 
153 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  36.49 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  35.46 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  30.77 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  35.66 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.86 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  35.94 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  35.77 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.37 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  37.67 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  37.67 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
238 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.08 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.06 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.59 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.16 
 
 
140 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  25.34 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  34.29 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30.6 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.21 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.33 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.06 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.05 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.88 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  34.56 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.56 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.56 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.31 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.86 
 
 
172 aa  52  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.12 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  34 
 
 
253 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  37.98 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  30.47 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.61 
 
 
138 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.03 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.17 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  22.7 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  27.83 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  33.08 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  28.35 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.48 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>