96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0485 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 154 aa  300  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  92.86 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.11 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.11 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.99 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.34 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  56.64 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  53.85 
 
 		 153 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  53.85 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  53.15 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.44 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.5 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.61 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.69 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.69 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  38.69 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.77 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.93 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.11 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  27.34 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  24.09 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.65 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.2 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.53 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  29.1 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  29.1 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  31.47 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.42 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.36 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  25.81 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.67 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.14 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  28.47 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 525 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  29.58 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.57 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  17.99 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.52 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  23.88 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.57 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  25.33 
 
 		 164 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  24.65 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.38 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>