140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15731 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
153 aa  296  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  82.35 
 
 
153 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  81.7 
 
 
153 aa  246  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  79.08 
 
 
151 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.17 
 
 
153 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.17 
 
 
153 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  57.52 
 
 
153 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.17 
 
 
153 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.99 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.99 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.89 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.45 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.45 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.07 
 
 
158 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.97 
 
 
163 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.41 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.44 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.52 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  36.69 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.94 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  28.17 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.68 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  24.83 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.3 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.03 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.13 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.28 
 
 
200 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.7 
 
 
189 aa  53.9  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.26 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.26 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  30.63 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  24.29 
 
 
166 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.92 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  29.9 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.06 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.89 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.2 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  23.36 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.28 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 
156 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 
189 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 
245 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  25.62 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.78 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.35 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.32 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.2 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.24 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  26.77 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  21.01 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>