37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1530 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 140 aa  268  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  55 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  52.14 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  37.86 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.88 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.36 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.36 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.36 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.14 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  35.16 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  36.27 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.65 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.55 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.13 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.13 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.74 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  32.8 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.58 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.91 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.91 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.88 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.06 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.12 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.12 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.79 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.71 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.74 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  35.48 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  34.25 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.32 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.78 
 
 		 154 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.96 
 
 		 167 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>