141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0245 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  100 
 
 
225 aa  446  1e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  82.19 
 
 
227 aa  340  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  56.36 
 
 
238 aa  243  2e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  44.69 
 
 
228 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
229 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
229 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 
229 aa  179  3e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  37.22 
 
 
232 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  31.84 
 
 
237 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  38.25 
 
 
225 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  35.68 
 
 
235 aa  143  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  30.63 
 
 
228 aa  127  1e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  30.53 
 
 
240 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  36.65 
 
 
228 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
240 aa  121  1e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  31.74 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.38 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  34.58 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  31.02 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  32.59 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  32.08 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  31.38 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  36.24 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  29 
 
 
235 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  30.8 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  29.82 
 
 
240 aa  84  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  30.37 
 
 
309 aa  83.2  3e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
233 aa  83.2  3e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  32.57 
 
 
259 aa  82.4  4e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  27.83 
 
 
227 aa  82.8  4e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  29.33 
 
 
253 aa  82.8  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  35.04 
 
 
229 aa  81.6  9e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  25 
 
 
232 aa  80.5  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  29.44 
 
 
241 aa  80.1  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  28.05 
 
 
224 aa  79.3  4e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  30.56 
 
 
240 aa  79  5e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
226 aa  79.3  5e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  29.07 
 
 
226 aa  77.8  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  27.16 
 
 
240 aa  77.4  2e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
229 aa  77  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
224 aa  76.3  3e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  29.07 
 
 
226 aa  76.6  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
232 aa  76.6  3e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  30.71 
 
 
250 aa  76.3  4e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  30.73 
 
 
229 aa  75.9  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
239 aa  74.3  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  28.19 
 
 
228 aa  74.7  1e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  26.72 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 
230 aa  73.9  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  26.87 
 
 
236 aa  73.6  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  26.76 
 
 
228 aa  73.9  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  31.98 
 
 
226 aa  73.6  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  25.89 
 
 
243 aa  73.9  2e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  31.39 
 
 
237 aa  73.9  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 
226 aa  73.2  3e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.66 
 
 
225 aa  72.8  4e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
224 aa  72.4  6e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  31.74 
 
 
224 aa  72  6e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.8 
 
 
231 aa  72  7e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 
226 aa  71.2  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 
226 aa  71.2  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.45 
 
 
228 aa  70.1  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
228 aa  70.1  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  30.97 
 
 
247 aa  70.1  3e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
228 aa  69.7  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
245 aa  69.7  3e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  27.65 
 
 
227 aa  70.1  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  27.31 
 
 
226 aa  69.7  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 
221 aa  68.9  5e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  28.77 
 
 
238 aa  68.9  5e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  28.24 
 
 
224 aa  68.9  5e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 
224 aa  68.9  6e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.32 
 
 
230 aa  68.6  7e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  29.02 
 
 
224 aa  68.6  7e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  31.14 
 
 
227 aa  67.8  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  30.37 
 
 
239 aa  68.2  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  28.89 
 
 
227 aa  68.2  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  25.94 
 
 
223 aa  67.8  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  26.72 
 
 
240 aa  67.4  1e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  29.17 
 
 
224 aa  67  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  30.43 
 
 
210 aa  66.6  3e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  29.36 
 
 
251 aa  66.6  3e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  31.62 
 
 
238 aa  66.2  4e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  30.67 
 
 
226 aa  65.9  5e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
226 aa  65.9  5e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  31.96 
 
 
215 aa  65.5  6e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  29.17 
 
 
224 aa  65.5  7e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  22.86 
 
 
208 aa  65.1  9e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
230 aa  64.3  1e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  29.25 
 
 
244 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  29.39 
 
 
224 aa  63.5  2e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  29.15 
 
 
210 aa  63.2  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  26.07 
 
 
227 aa  62.4  5e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  31.33 
 
 
243 aa  62  7e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 
210 aa  61.6  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  25.57 
 
 
230 aa  61.2  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  28.25 
 
 
214 aa  60.5  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  25.85 
 
 
231 aa  60.5  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.86 
 
 
232 aa  60.8  2e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>