More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0485 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  100 
 
 		 75 aa  150  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  64.38 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  59.46 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  55.22 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  55.88 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 80 aa  83.6  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4554  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0362577  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  62.9 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5066  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  62.3 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 73 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  59.38 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  57.38 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  60.34 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  61.29 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  54.93 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  49.3 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  53.52 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  59.68 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>