More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2460 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  100 
 
 		 106 aa  216  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  65.75 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  60.92 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 75 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  66.22 
 
 		 75 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  63.16 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  61.84 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  68.57 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  64.38 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  68.57 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  62.82 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  61.84 
 
 		 79 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  64.38 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  67.14 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  64.86 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 92 aa  95.9  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  65.28 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 92 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 82 aa  95.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  59.76 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  63.51 
 
 		 75 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  63.89 
 
 		 74 aa  94.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  61.33 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  66.18 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  63.64 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  58.82 
 
 		 74 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  46.94 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  67.21 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.7 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.7 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.7 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  51.32 
 
 		 79 aa  87.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  53.16 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 74 aa  84.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  62.3 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  48.72 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  60.94 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>