45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0091 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1198  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0991  hypothetical protein  40.85 
 
 
295 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1636  hypothetical protein  31.65 
 
 
260 aa  79  2e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1644  hypothetical protein  33.57 
 
 
378 aa  77  8e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.112699  hitchhiker  0.00252347 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  25.21 
 
 
589 aa  75.9  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1206  hypothetical protein  30.77 
 
 
854 aa  72  3e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  26.8 
 
 
807 aa  69.3  2e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  25.26 
 
 
651 aa  68.9  3e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  26.44 
 
 
478 aa  67  9e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  29.45 
 
 
552 aa  65.5  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  27.9 
 
 
324 aa  62.8  2e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  23.18 
 
 
602 aa  62  3e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.37 
 
 
2821 aa  61.6  4e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  27.89 
 
 
434 aa  60.8  6e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  25.62 
 
 
532 aa  59.3  2e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28.1 
 
 
573 aa  59.3  2e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.59659e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  28.65 
 
 
502 aa  58.9  3e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  22.04 
 
 
613 aa  57.4  6e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  27.12 
 
 
330 aa  57.4  8e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.89 
 
 
762 aa  56.6  1e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  26.21 
 
 
1557 aa  56.2  2e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3539  hypothetical protein  30.37 
 
 
336 aa  55.5  3e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000208297  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.32 
 
 
811 aa  54.7  4e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  25.19 
 
 
757 aa  55.1  4e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  31.09 
 
 
817 aa  53.1  1e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  27 
 
 
1527 aa  52.4  2e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  22.64 
 
 
420 aa  53.1  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  29.33 
 
 
578 aa  51.6  4e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.07 
 
 
891 aa  51.2  5e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  25.56 
 
 
465 aa  50.8  6e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  29.56 
 
 
454 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  26.78 
 
 
1131 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  25.62 
 
 
316 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72933e-07 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  26.78 
 
 
1131 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  3.20353e-07 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  34.62 
 
 
342 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.36 
 
 
550 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  23.61 
 
 
750 aa  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  31.03 
 
 
302 aa  47.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  25.45 
 
 
377 aa  47.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  27.05 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  27.05 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.81 
 
 
2495 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  26.95 
 
 
753 aa  44.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  3.30124e-05  hitchhiker  1.07499e-11 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  24.45 
 
 
1363 aa  44.3  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  28.16 
 
 
440 aa  43.9  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>