More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2141 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  83.44 
 
 
214 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  83.44 
 
 
215 aa  260  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  82.69 
 
 
215 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.3 
 
 
253 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  35.94 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.38 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  31.32 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
253 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 
135 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  31.32 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  38.28 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  38.32 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  31.76 
 
 
144 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
137 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  43.94 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  51.47 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
253 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  39.62 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
254 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
254 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
254 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
131 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 
253 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.58 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
134 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 
256 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 
135 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 
247 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  32.52 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  34.06 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
138 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  53.03 
 
 
142 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 
288 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
247 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
342 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 
137 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
342 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>