More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1983 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
313 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275914  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  71.15 
 
 
312 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1858  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  70.19 
 
 
312 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2087  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  69.87 
 
 
312 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  51.27 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.73 
 
 
323 aa  248  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  43.77 
 
 
316 aa  246  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
334 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  51.54 
 
 
327 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.46 
 
 
326 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  44.76 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.42 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  49.05 
 
 
274 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.22 
 
 
323 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  44.51 
 
 
334 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  44.79 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  44.41 
 
 
333 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  48.79 
 
 
319 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  45.45 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  45.45 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  41.61 
 
 
317 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  45.65 
 
 
323 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.33 
 
 
324 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  41.56 
 
 
334 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.16 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  43.08 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  43.08 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  51.72 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.51 
 
 
320 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  44.44 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  43.75 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  42.55 
 
 
357 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  43.17 
 
 
333 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  40.06 
 
 
334 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  38.85 
 
 
322 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  41.64 
 
 
319 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.48 
 
 
323 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.35 
 
 
323 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  38.54 
 
 
322 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  42.9 
 
 
315 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  39.56 
 
 
339 aa  226  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  43.75 
 
 
333 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.69 
 
 
333 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.65 
 
 
318 aa  221  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  42.86 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  46.62 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  39.25 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  42.31 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  39.74 
 
 
328 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  40.62 
 
 
334 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0636  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.33 
 
 
313 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.51 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.21 
 
 
338 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  40.2 
 
 
311 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.62 
 
 
334 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.62 
 
 
328 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0476  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  52.29 
 
 
319 aa  215  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  50 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  40.69 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.07 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  43.43 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  47.16 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  49.62 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  41.29 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5274  2-oxo-carboxylic acid reductase  44.7 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.060583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  47.65 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  44.51 
 
 
332 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  40.32 
 
 
332 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  39.87 
 
 
333 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.13 
 
 
333 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  39.5 
 
 
333 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  42.99 
 
 
340 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  42.68 
 
 
324 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1642  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.95 
 
 
317 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881641  normal  0.0688887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  41.74 
 
 
324 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5208  Glyoxylate reductase  48.42 
 
 
309 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  32.75 
 
 
319 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  39.18 
 
 
333 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.25 
 
 
335 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3326  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.18 
 
 
316 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  41.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  41.43 
 
 
324 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  41.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  41.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  41.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  41.43 
 
 
324 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  35 
 
 
322 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.87 
 
 
333 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  46.18 
 
 
348 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.01 
 
 
329 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  47.01 
 
 
352 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.13 
 
 
329 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558591  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.13 
 
 
329 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.62 
 
 
338 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.13 
 
 
329 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.43 
 
 
324 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  43.23 
 
 
336 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  41.12 
 
 
324 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  49.8 
 
 
325 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>