82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6486 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  43.46 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  47.31 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  38.61 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  39.84 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  43.08 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  39.77 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  39.69 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  40.08 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  37.69 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  41.06 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.54 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  38.93 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  36.25 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  32.18 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  31.3 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  35.18 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  30.3 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  34.48 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  28.46 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  30.34 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  28.02 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  29.73 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  23.95 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  26.38 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  25.98 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  22.13 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.78 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  23.77 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.17 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  23.77 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  30.12 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  26.98 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  26.98 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  28.63 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  28.63 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  26.1 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  26.48 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  27.23 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  27.44 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  24.53 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  20.52 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.65 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  26.47 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  21.34 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  19.55 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  21.05 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  19.85 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  26.22 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  25.95 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  24.53 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.31 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.31 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  23.32 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  23.62 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  22.09 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  22.51 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  34.26 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  24.54 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  20.66 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  25.48 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  24.34 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  25.56 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  25.56 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  25.23 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  26.82 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  23.78 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>