More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6344 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  56.11 
 
 		 841 aa  907    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  67.43 
 
 		 838 aa  1095    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  52.67 
 
 		 836 aa  816    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 822 aa  1649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 841 aa  515  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  49.5 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  41.46 
 
 		 569 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2744  glycosyl transferase, group 1  41.01 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0287035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 355 aa  150  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 318 aa  144  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  37.25 
 
 		 291 aa  138  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.94 
 
 		 320 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 350 aa  137  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  30.42 
 
 		 338 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 294 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 1739 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  36.32 
 
 		 283 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 359 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 337 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 346 aa  127  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 401 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 345 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.42 
 
 		 348 aa  125  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.14 
 
 		 358 aa  125  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 313 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 298 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 334 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.11 
 
 		 336 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.32 
 
 		 2401 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 		 279 aa  121  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 337 aa  121  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 		 1267 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 1267 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 703 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 303 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 		 332 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 1340 aa  118  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 325 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 345 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 312 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 340 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 288 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 305 aa  114  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 300 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 340 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 329 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 311 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 331 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 1106 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 340 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25 
 
 		 330 aa  111  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 307 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 358 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 335 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 282 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 366 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 525 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 300 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 339 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 378 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 328 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 291 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 330 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 337 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 336 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  30.55 
 
 		 320 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 321 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 290 aa  104  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 824 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 320 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  31.47 
 
 		 323 aa  101  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 337 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 1077 aa  101  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 307 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 310 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 319 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  31.23 
 
 		 339 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  31.23 
 
 		 339 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 314 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 317 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 282 aa  98.6  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 337 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 346 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 297 aa  98.2  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 318 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 1152 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.55 
 
 		 311 aa  97.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 304 aa  97.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 616 aa  97.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.67 
 
 		 284 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 477 aa  96.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 303 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>