189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5732 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  45.5 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.77 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.1 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  43.78 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  42.47 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  44.04 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  38.53 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  39.55 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.33 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  41.47 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  35.09 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.76 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  31.6 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  35.1 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.44 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.65 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  42.07 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  36.32 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.68 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  32.88 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  36.02 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  35.45 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  36 
 
 		 197 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  43.7 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  34.56 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  34.86 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  34.86 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  35.55 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.98 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  32.84 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.01 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.98 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  33.17 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.17 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  33.17 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.17 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.43 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.84 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  34.5 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.33 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  32.52 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  30.8 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.68 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.68 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.68 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  35.1 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.01 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.47 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.28 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  34.47 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  32.85 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  32.49 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  29.72 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  33.66 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  38.05 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.55 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.06 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.98 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.4 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  38.58 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  30.4 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  37.29 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.58 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  37.29 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  38.26 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.66 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.85 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.83 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  36.44 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  30.26 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.38 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  30.73 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  38.6 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  32.45 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  29.7 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  30.94 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.4 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  30.05 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.59 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  36.3 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  34.39 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.39 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.39 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  32 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>