49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0969 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  48.18 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  42.98 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 		 1039 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  36.04 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.59 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  32.64 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 		 855 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  45.56 
 
 		 693 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.15 
 
 		 738 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.59 
 
 		 952 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.68 
 
 		 1045 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.73 
 
 		 591 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.58 
 
 		 688 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1921  hypothetical protein  35.63 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 		 713 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  38.04 
 
 		 771 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  29.09 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.97 
 
 		 817 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  31.06 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.73 
 
 		 573 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.83 
 
 		 549 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  36.96 
 
 		 745 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  32.97 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 		 135 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 		 697 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.86 
 
 		 750 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  30.25 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 255 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30.36 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 		 716 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>