39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3554 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  45.24 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  35.43 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  37.98 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 		 693 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.76 
 
 		 616 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 		 716 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 		 1225 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 		 745 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 		 713 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.2 
 
 		 817 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 324 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 		 468 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  36.26 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  35.71 
 
 		 771 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4105  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0408449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 855 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  35.65 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 492 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  30.17 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.72 
 
 		 952 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>