30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4139 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5442  putative signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5037  putative signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.476889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1352  hypothetical protein  44.88 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  44.74 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1268  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  36.29 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  32.26 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.1 
 
 		 738 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.77 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  38 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  39.6 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  34.94 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 1045 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0198  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0791059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  38.78 
 
 		 697 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  29.29 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.75 
 
 		 855 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 713 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.72 
 
 		 693 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>