More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0267 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 149 aa  296  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  55.94 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 148 aa  159  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  55 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  41.13 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  41.13 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  42.14 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  37.68 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  35.97 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 167 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  40.71 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 164 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 161 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 167 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 159 aa  93.2  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.61 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 186 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.41 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.81 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.94 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>