242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1831 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 447 aa  848    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  34.48 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  34.4 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  34.88 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  32.54 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  33.04 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  28.97 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  33.47 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  33.11 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  33.26 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  33.55 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  26.58 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  32.42 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  32.47 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  28.88 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  33.77 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  33.77 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  35.32 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  31.85 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  25.76 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  33.41 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  32.23 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  34.47 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  27.17 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  35.59 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  32.03 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  31.52 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  34.3 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  28.42 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  31.8 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.28 
 
 		 482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  32.04 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  32.04 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.61 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  30.02 
 
 		 453 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  26.04 
 
 		 491 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.5 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.08 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  30.07 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  23.5 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  30.62 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  29.21 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  27.18 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 		 469 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.8 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  27.21 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  21.96 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.93 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  27.18 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.51 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  27.81 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  26.6 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.31 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  28.03 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  26.75 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  25.76 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  22.7 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  29.06 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  21.81 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  23.57 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  27.34 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  25.47 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  28.24 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  28.24 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  25 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  26.06 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  25.14 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  27.86 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>