More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1268 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  36.61 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  35.91 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  37.63 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  32.88 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  38.05 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 309 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  34.9 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  36.86 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.12 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  34.56 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  34.03 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  35.93 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  34.53 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  37.92 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  30.8 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  31.72 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  32.54 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  36.63 
 
 		 327 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0201  GTP-binding protein Era  35.97 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3454  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  34.44 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  32.3 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  34.41 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  32.99 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  37.04 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 313 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  35.02 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.74 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  34.08 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  35.58 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  32.3 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  36.67 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0524  GTP-binding protein Era  34.56 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  31.49 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  30.58 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  35.42 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  35.57 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  30.58 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  30.34 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  31.99 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  31.99 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  34.47 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  35.45 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 307 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2570  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 304 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  30.58 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  33.12 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  34.25 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  32.29 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 318 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  33.78 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>