More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0861 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 353 aa  719    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  71.63 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  50.8 
 
 		 300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  50.92 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  49.04 
 
 		 298 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  53.46 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  51.27 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  51.77 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  50.79 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  50.48 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  49.21 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  49.52 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  48.72 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  49.24 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  49.38 
 
 		 319 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  46.79 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  46.79 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  50.16 
 
 		 304 aa  289  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  49.54 
 
 		 318 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  47.48 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  49.04 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  50.16 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  46.95 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  46.3 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  46.65 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  47.76 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  47.76 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  44.23 
 
 		 298 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  47.76 
 
 		 299 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  46.5 
 
 		 297 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  50.63 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  47.37 
 
 		 321 aa  272  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  47.78 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  46.83 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  42.63 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 299 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 299 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  40.5 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  37.94 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 301 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  37.94 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 		 301 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 		 301 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 		 301 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 		 301 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.82 
 
 		 301 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.23 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  37.18 
 
 		 301 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.33 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  37.62 
 
 		 299 aa  222  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  36.22 
 
 		 302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.14 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.55 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  38.78 
 
 		 303 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  37.42 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  36.42 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  35.95 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  34.62 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  34.73 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  36.01 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  33.76 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  35.35 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  34.73 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  35.78 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 		 296 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  36.83 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  35.24 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  35.76 
 
 		 305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  36.28 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  32.8 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  35.69 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  37.74 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  36.01 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  35.58 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  33.97 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  34.98 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  35.69 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  33.87 
 
 		 313 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  33.65 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  33.12 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  35.83 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  33.76 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  35.08 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  35.14 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>