More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1580 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  66.79 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  64.07 
 
 		 298 aa  353  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  64.44 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  64.44 
 
 		 299 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  64.71 
 
 		 311 aa  337  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  64.21 
 
 		 315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  63.97 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  64.39 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  63.24 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  62.55 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  63.97 
 
 		 303 aa  328  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  62.96 
 
 		 306 aa  327  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  61.17 
 
 		 314 aa  324  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  61.17 
 
 		 304 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 		 307 aa  316  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  58.09 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  60.36 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  60.29 
 
 		 299 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  60.29 
 
 		 299 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  61.59 
 
 		 375 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  60.44 
 
 		 305 aa  314  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  57.41 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  60.07 
 
 		 310 aa  312  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  58.99 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  59.78 
 
 		 297 aa  308  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  55.23 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  58.72 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  58.06 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  58.97 
 
 		 312 aa  294  9e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  59.36 
 
 		 319 aa  291  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  59.21 
 
 		 313 aa  291  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  58.09 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  56.03 
 
 		 321 aa  275  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  54.41 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  46.83 
 
 		 353 aa  261  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  47.54 
 
 		 354 aa  258  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.22 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.85 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  41.91 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  41.54 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  43.01 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  37.78 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.12 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.15 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.15 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.85 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  42.65 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.11 
 
 		 299 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  36.4 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  39.42 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  40.29 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  38.75 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  34.44 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  35.56 
 
 		 305 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  38.32 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  40.29 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 299 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  43.91 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.09 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 451 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  35.79 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  39.63 
 
 		 312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  36.8 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 343 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 449 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  34.67 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  39.27 
 
 		 307 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  35.56 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  36.19 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  36.4 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  36.76 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  34.93 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  35.66 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  35.66 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.13 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  35.79 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>