291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0457 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 149 aa  276  9e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  41.51 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  41.51 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.3 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.71 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.06 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  31.58 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.9 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  34.92 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  35.56 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  43.48 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  44.44 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  27.13 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  36.56 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  39.2 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  38.39 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  29.03 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.13 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.33 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.78 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.5 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  36.52 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  47.95 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  32.73 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  36.29 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.61 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  35.9 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  46.67 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  35.64 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  34.75 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  38.46 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  32.73 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.19 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  33.9 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  35.34 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  33.59 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  38.82 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.72 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  29.51 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  38.93 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>