217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0167 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  100 
 
 		 322 aa  652    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  59.74 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  49.51 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  46.6 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.21 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  45.36 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.78 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.28 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.43 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.64 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.46 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  40.88 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  41.08 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.14 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  39.46 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.89 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  39.23 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  39.23 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  39.34 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  38.8 
 
 		 333 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  38.25 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.84 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  33.18 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  32.43 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.96 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.92 
 
 		 695 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.52 
 
 		 716 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  31.52 
 
 		 219 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  29.47 
 
 		 209 aa  89.4  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.21 
 
 		 433 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  29.63 
 
 		 213 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  31.22 
 
 		 209 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  32.54 
 
 		 216 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  31.02 
 
 		 213 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  31.02 
 
 		 213 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  31.02 
 
 		 213 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  31.02 
 
 		 213 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  31.52 
 
 		 204 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.65 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  31.98 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  31.98 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  29.95 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  30.48 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  29.3 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  29.47 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  29.47 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  29.47 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  30.54 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  29.41 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  29.41 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  32.04 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  29.41 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  29.41 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  29.47 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  29.35 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  29.03 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.41 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  28.19 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  30.77 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.87 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  28.64 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  28.96 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.78 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  28.88 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  29.41 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.72 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  28.96 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  27.81 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.67 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  27.93 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.91 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  27.81 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  34.32 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  26.92 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  29.26 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.19 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  26.98 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  26.73 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  29.27 
 
 		 201 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  27.91 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.87 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  30.18 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  29.57 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  30.95 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  27.66 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>