More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1647 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  56.63 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 		 230 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  42.27 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  42.94 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  43.41 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.46 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.95 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  45 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.64 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.52 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.99 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  37.29 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  43.62 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.3 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  39.47 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  38.78 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  36.73 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  36.9 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.22 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  35.84 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  35.88 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  35.11 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.96 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  38.69 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.52 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  33.95 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.02 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  31.63 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  30.14 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  37.3 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32.93 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  39.29 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  38.27 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  33.77 
 
 		 157 aa  97.8  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.5 
 
 		 260 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  31.63 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  31.02 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  30.7 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  30.7 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  30.7 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  30.7 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  38.65 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  30.19 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  29.67 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  29.34 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.44 
 
 		 195 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35.26 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  32.56 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  32.56 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  29.17 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  32.16 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  31.98 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  31.98 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  32.16 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  32.11 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.71 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 250 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  32.05 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  34.64 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.47 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>