242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1448 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  48.36 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  48.36 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  51.67 
 
 
295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  49.02 
 
 
293 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  44.22 
 
 
299 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  49.35 
 
 
295 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  48 
 
 
310 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  42.81 
 
 
295 aa  218  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  47.35 
 
 
295 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  46.86 
 
 
294 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  43.19 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  40.67 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  48.17 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  44.48 
 
 
295 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  42.33 
 
 
295 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  43 
 
 
295 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  45.36 
 
 
294 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  45.54 
 
 
296 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  45.54 
 
 
296 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  44.85 
 
 
294 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  44.44 
 
 
294 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  44.82 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  46.03 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  45.87 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  43.37 
 
 
295 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  41.64 
 
 
295 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  44.7 
 
 
304 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  43.79 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  44.37 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  47.68 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  41.25 
 
 
296 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  44.11 
 
 
287 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  40.4 
 
 
288 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  45.51 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  40.52 
 
 
288 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  46.15 
 
 
291 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  40.98 
 
 
298 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  41.06 
 
 
309 aa  185  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  37.67 
 
 
288 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  39.07 
 
 
287 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  40.07 
 
 
287 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  39.67 
 
 
287 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  38.33 
 
 
288 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  39.07 
 
 
287 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  38.74 
 
 
287 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  38.49 
 
 
288 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  39.4 
 
 
287 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  37.67 
 
 
287 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  38.19 
 
 
287 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  40.2 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  38.8 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  39.6 
 
 
288 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.45 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  38.13 
 
 
287 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  38.87 
 
 
288 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  38.26 
 
 
288 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  37.79 
 
 
287 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  38.61 
 
 
288 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  40.91 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  42.14 
 
 
288 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  36.54 
 
 
287 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  37.21 
 
 
287 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  37.21 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  39.48 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  36 
 
 
288 aa  166  4e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  36.88 
 
 
287 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  39 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  40.13 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  40.07 
 
 
287 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  38.54 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  41.86 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  41.14 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  35.97 
 
 
287 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  41.86 
 
 
287 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  40.47 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  35.79 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  38.21 
 
 
287 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  37.87 
 
 
287 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  40.47 
 
 
287 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  37.62 
 
 
300 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  40.8 
 
 
287 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  34.31 
 
 
294 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  36.96 
 
 
297 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>