More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4607 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
348 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  53.33 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  53.67 
 
 
324 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  53.18 
 
 
322 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  52.51 
 
 
327 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  51.69 
 
 
330 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 
330 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  51.69 
 
 
330 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  52.27 
 
 
341 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  52.17 
 
 
327 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  51.5 
 
 
331 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  52.14 
 
 
309 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
311 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
311 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  49.67 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  50 
 
 
311 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  52.11 
 
 
323 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
311 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
311 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  49.67 
 
 
311 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  49.34 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  49.01 
 
 
311 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  49.01 
 
 
311 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  50.33 
 
 
314 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  48.36 
 
 
311 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
324 aa  259  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  48.39 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  48.39 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  48.23 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.65 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
313 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 
330 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  48.68 
 
 
310 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  46.75 
 
 
322 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  47.44 
 
 
330 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  47.44 
 
 
330 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  50.34 
 
 
311 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  46.63 
 
 
346 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  48.74 
 
 
321 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.18 
 
 
310 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
835 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
321 aa  248  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  49.83 
 
 
334 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  50.34 
 
 
322 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  46.84 
 
 
310 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  45.62 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  48.79 
 
 
345 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  46.51 
 
 
315 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  47.57 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  50.83 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  47.57 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  45.87 
 
 
320 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  48.05 
 
 
321 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  47.77 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  45.66 
 
 
325 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  49.84 
 
 
343 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
340 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  48.24 
 
 
313 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  45.25 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 
350 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  47.37 
 
 
322 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  47.31 
 
 
322 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  44.38 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  49.16 
 
 
336 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  45.28 
 
 
324 aa  235  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 
306 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  44.54 
 
 
338 aa  232  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  46.46 
 
 
336 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.28 
 
 
342 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  47.3 
 
 
318 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  43.71 
 
 
345 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  46.84 
 
 
325 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
342 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  47.88 
 
 
342 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  47.88 
 
 
342 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  43.79 
 
 
335 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  46.86 
 
 
333 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  47.54 
 
 
314 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  45.48 
 
 
316 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  48.62 
 
 
332 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  40.5 
 
 
326 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  40.5 
 
 
326 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  40.5 
 
 
326 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  40.5 
 
 
326 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  40.5 
 
 
326 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
342 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>