215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1381 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
463 aa  868    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  56.11 
 
 
479 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  56.77 
 
 
482 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  52.39 
 
 
477 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  51.93 
 
 
488 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  50.64 
 
 
488 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  56.55 
 
 
493 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  51.09 
 
 
460 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  48.25 
 
 
471 aa  323  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  47.72 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  46.09 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  50 
 
 
454 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  46.32 
 
 
488 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  47.35 
 
 
475 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  48.34 
 
 
482 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  45.39 
 
 
482 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  43.05 
 
 
469 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  35.85 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  43.58 
 
 
477 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  34.44 
 
 
474 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 
482 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  32.68 
 
 
473 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  42.06 
 
 
469 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  42.03 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  31.95 
 
 
473 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 
473 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 
473 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 
473 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  31.02 
 
 
473 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  31.45 
 
 
473 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  31.24 
 
 
473 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  31.45 
 
 
473 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 
473 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  34.82 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  35.96 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  35.41 
 
 
490 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  33.61 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  39.57 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  31.46 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  37.37 
 
 
460 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  39.3 
 
 
475 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  28.06 
 
 
466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 
466 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  39.32 
 
 
451 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  39.32 
 
 
451 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  39.7 
 
 
451 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  27.23 
 
 
466 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  27 
 
 
466 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  27 
 
 
466 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  26.85 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 
463 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
509 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  33.69 
 
 
470 aa  189  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  34.84 
 
 
459 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  26.58 
 
 
466 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  27.19 
 
 
466 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  27.55 
 
 
466 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  26.96 
 
 
463 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  41.61 
 
 
453 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.45 
 
 
421 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  35.4 
 
 
447 aa  183  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  31.78 
 
 
470 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  37.42 
 
 
454 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  32.75 
 
 
467 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  35.97 
 
 
476 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 
472 aa  156  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  28.75 
 
 
495 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  28.36 
 
 
469 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  28.48 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 
469 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  33.18 
 
 
476 aa  136  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  31.14 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  31.14 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.82 
 
 
491 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  34.49 
 
 
479 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 
467 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  29.19 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  28.09 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
441 aa  117  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  29.72 
 
 
462 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  28.8 
 
 
502 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  25.9 
 
 
482 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.1 
 
 
465 aa  99  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  25.49 
 
 
454 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  31.74 
 
 
531 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.25 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  29.17 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  30.21 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  33.86 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  21.86 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.83 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  25.12 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  22.96 
 
 
435 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>