218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0966 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 484 aa  994    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  62.5 
 
 		 482 aa  611  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  60.74 
 
 		 486 aa  590  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  59.08 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  57.88 
 
 		 484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  56.52 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  58.66 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  58.42 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  58.87 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  59.88 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  59.47 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  59.88 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  59.75 
 
 		 486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  57.56 
 
 		 486 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  56.73 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  56.37 
 
 		 480 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  56.37 
 
 		 477 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  55.21 
 
 		 482 aa  544  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  59.05 
 
 		 484 aa  545  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  58.51 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  55.39 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  57.71 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  55.95 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  54.6 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  55.63 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  56.58 
 
 		 478 aa  524  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  55.32 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  54.7 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  52.07 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  52.28 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  52.28 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  54.91 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  53.03 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  53.31 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  50.73 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  49.28 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  50.1 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  50.52 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  50.31 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  51.15 
 
 		 488 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  52.21 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  48.96 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  50.73 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  48.75 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  54.72 
 
 		 963 aa  464  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  51.96 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  51.56 
 
 		 486 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  51.03 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  52.58 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  48.39 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.38 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  51.96 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  48.55 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  49.16 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  50.63 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  48.28 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  47.5 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  48.12 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  47.5 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  48.75 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  49.38 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  50.83 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  53.64 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  52.21 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  45.62 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  52.21 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  51.58 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  51.14 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  48.52 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  54.4 
 
 		 988 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  48.33 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  52.16 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  43.6 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  41.01 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.14 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  32.76 
 
 		 451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.75 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.54 
 
 		 396 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  30.68 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  29.82 
 
 		 466 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  29.94 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.28 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  30.28 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  30.28 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  30.28 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  30.07 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  30.28 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  30.28 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  30.52 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  31.45 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.68 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.72 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  30.66 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  30.75 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.46 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  29.98 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.14 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  29.66 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>