61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1612 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  100 
 
 
892 aa  1808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  38.15 
 
 
413 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  36.73 
 
 
739 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  33.89 
 
 
736 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  35.08 
 
 
744 aa  191  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  39.8 
 
 
815 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  39.8 
 
 
815 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  34.39 
 
 
509 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  35.75 
 
 
695 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  36.39 
 
 
789 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  35.12 
 
 
818 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  33.24 
 
 
835 aa  162  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  34.29 
 
 
781 aa  155  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  33.53 
 
 
789 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  30.13 
 
 
896 aa  152  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  35.42 
 
 
788 aa  152  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  35.42 
 
 
788 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  30.92 
 
 
489 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  30.8 
 
 
806 aa  122  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  27.67 
 
 
697 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  37.5 
 
 
662 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  30.83 
 
 
736 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  31.23 
 
 
834 aa  101  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  28.81 
 
 
476 aa  99  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  31.38 
 
 
838 aa  95.9  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  26.81 
 
 
761 aa  90.9  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal 
 
 
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  32.67 
 
 
739 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  25.86 
 
 
725 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  28.19 
 
 
979 aa  82.4  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  26.32 
 
 
778 aa  81.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  27.31 
 
 
812 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  41.23 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  29.84 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  30.85 
 
 
930 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  34.59 
 
 
400 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  36.94 
 
 
841 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  27.04 
 
 
610 aa  64.7  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4213  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.936932  normal  0.431658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  26.32 
 
 
765 aa  61.6  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  60.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.47 
 
 
759 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  29.93 
 
 
755 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.77 
 
 
738 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  27.4 
 
 
716 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  33.63 
 
 
847 aa  55.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  26.41 
 
 
720 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  26.41 
 
 
712 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  26.41 
 
 
712 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  25.51 
 
 
431 aa  54.3  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.06 
 
 
712 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  37.04 
 
 
102 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  33.68 
 
 
731 aa  52.4  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  39.13 
 
 
610 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.06 
 
 
712 aa  51.6  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  41.1 
 
 
682 aa  49.7  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  24.58 
 
 
597 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  27.91 
 
 
749 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  27.33 
 
 
748 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  38.67 
 
 
218 aa  48.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  25.45 
 
 
845 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>