More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0616 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  831    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  100 
 
 
414 aa  831    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  47.57 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  37.47 
 
 
386 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
390 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  42.18 
 
 
415 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  38.02 
 
 
382 aa  196  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
396 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  35.21 
 
 
389 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.72 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
475 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
411 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
535 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
390 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
405 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.17 
 
 
416 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
904 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
406 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
395 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.71 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.94 
 
 
723 aa  126  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
405 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
426 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.32 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.87 
 
 
404 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
575 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
419 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
402 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
401 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
376 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
376 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
402 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
374 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.33 
 
 
401 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  30.55 
 
 
557 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
768 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
378 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
376 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
390 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
402 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
377 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
388 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
370 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
398 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
384 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
390 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
394 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
381 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31.71 
 
 
388 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
386 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
536 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  28.53 
 
 
569 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.42 
 
 
745 aa  96.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
365 aa  96.3  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  28.73 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.08 
 
 
399 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
413 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
379 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
373 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.94 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
436 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
389 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  32.06 
 
 
573 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>