1422 genes were found for organism Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ccur_00010  CDS  NC_013170  130  1650  1521  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003150420  normal  0.993036  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00020  CDS  NC_013170  1872  2969  1098  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003150421  normal  0.443906  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00030  CDS  NC_013170  2977  4113  1137  recF protein  YP_003150422  normal  0.172429  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00040  CDS  NC_013170  4103  4654  552  hypothetical protein  YP_003150423  normal  0.018938  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00050  CDS  NC_013170  4816  6753  1938  DNA gyrase subunit B  YP_003150424  normal  0.0377504  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00060  CDS  NC_013170  6797  9409  2613  DNA gyrase subunit A  YP_003150425  hitchhiker  0.00061935  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00070  tRNA  NC_013170  9520  9596  77  tRNA-Ile    hitchhiker  7.58823e-06  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00080  tRNA  NC_013170  9672  9747  76  tRNA-Ala    hitchhiker  9.07858e-06  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00090  CDS  NC_013170  9818  10384  567  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  YP_003150426  decreased coverage  5.77913e-07  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00100  CDS  NC_013170  10384  12198  1815  GTP-binding protein TypA/BipA  YP_003150427  decreased coverage  1.72571e-05  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00110  CDS  NC_013170  12702  12818  117  hypothetical protein  YP_003150428  hitchhiker  0.000691982  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00120  rRNA  NC_013170  12849  14352  1504  16S ribosomal RNA    normal  0.0247514  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00130  rRNA  NC_013170  14822  17843  3022  23S ribosomal RNA    normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00140  CDS  NC_013170  18251  19192  942  thiamine biosynthesis lipoprotein  YP_003150429  normal  normal  0.594186  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00150  CDS  NC_013170  19329  20315  987  L-asparaginase type II family protein  YP_003150430  normal  normal  0.589872  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00160  CDS  NC_013170  20541  22661  2121  DNA/RNA helicase, superfamily I  YP_003150431  normal  normal  0.805287  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00170  CDS  NC_013170  22665  22889  225  hypothetical protein  YP_003150432  normal  normal  0.729028  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00180  CDS  NC_013170  23263  24135  873  methionine aminopeptidase, type I  YP_003150433  normal  normal  0.55421  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00190  CDS  NC_013170  24114  24995  882  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase /5,10-methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+)  YP_003150434  normal  normal  0.483719  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00200  CDS  NC_013170  25000  25632  633  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_003150435  normal  normal  0.322798  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00210  CDS  NC_013170  25897  27735  1839  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  YP_003150436  normal  normal  0.301732  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00220  CDS  NC_013170  27728  30448  2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  YP_003150437  normal  normal  0.0797991  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00230  CDS  NC_013170  30745  32997  2253  dipeptidase  YP_003150438  normal  hitchhiker  0.00762022  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00240  CDS  NC_013170  33290  34321  1032  hypothetical protein  YP_003150439  normal  hitchhiker  0.000336169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00250  CDS  NC_013170  34389  34883  495  hypothetical protein  YP_003150440  normal  hitchhiker  0.000127334  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00260  CDS  NC_013170  34906  35349  444  response regulator of the LytR/AlgR family  YP_003150441  normal  hitchhiker  0.000118135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00270  CDS  NC_013170  35641  36984  1344  signal transduction histidine kinase  YP_003150442  normal  hitchhiker  2.30413e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00280  CDS  NC_013170  36965  37669  705  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  YP_003150443  normal  hitchhiker  6.4956e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00290  CDS  NC_013170  37662  38204  543  UBA/TS-N domain-containing protein  YP_003150444  normal  hitchhiker  3.31222e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00300  CDS  NC_013170  38690  44140  5451  conserved repeat protein (List_Bact_rpt)  YP_003150445  normal  0.0283714  decreased coverage  3.90455e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00310  CDS  NC_013170  44311  44553  243  SSU ribosomal protein S16P  YP_003150446  unclonable  4.91979e-09  decreased coverage  3.78635e-12  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00320  CDS  NC_013170  44558  44812  255  RNA-binding protein (KH domain)  YP_003150447  hitchhiker  7.39144e-06  hitchhiker  3.55006e-12  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00330  CDS  NC_013170  44813  45517  705  16S rRNA processing protein RimM  YP_003150448  hitchhiker  0.000114022  hitchhiker  4.00055e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00340  CDS  NC_013170  45517  46272  756  tRNA (Guanine37-N(1)-) methyltransferase  YP_003150449  hitchhiker  0.00142568  hitchhiker  2.09047e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00350  CDS  NC_013170  46461  47036  576  signal peptidase I  YP_003150450  normal  0.0652665  hitchhiker  2.36329e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00360  CDS  NC_013170  47077  48198  1122  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_003150451  normal  0.148194  hitchhiker  1.13884e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00370  CDS  NC_013170  48203  50287  2085  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  YP_003150452  normal  0.740961  hitchhiker  2.47045e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00380  CDS  NC_013170  50284  51159  876  hypothetical protein  YP_003150453  normal  0.89921  hitchhiker  6.33643e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00390  CDS  NC_013170  51169  53880  2712  pyruvate phosphate dikinase  YP_003150454  normal  0.149609  hitchhiker  3.41949e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00400  CDS  NC_013170  54298  55869  1572  amino acid carrier protein  YP_003150455  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00410  CDS  NC_013170  56933  57535  603  uracil-DNA glycosylase  YP_003150456  normal  normal  0.188097  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00420  CDS  NC_013170  57883  58230  348  cupin domain-containing protein  YP_003150457  normal  normal  0.33037  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00430  CDS  NC_013170  58347  59252  906  hypothetical protein  YP_003150458  normal  normal  0.381463  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00440  CDS  NC_013170  59386  60717  1332  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  YP_003150459  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00450  CDS  NC_013170  60794  60949  156  hypothetical protein  YP_003150460  normal  normal  0.721349  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00460  CDS  NC_013170  61126  62679  1554  hypothetical protein  YP_003150461  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00470  CDS  NC_013170  62764  62925  162  hypothetical protein  YP_003150462  normal  0.63141  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00480  CDS  NC_013170  63325  65145  1821  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  YP_003150463  decreased coverage  0.00118843  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00490  CDS  NC_013170  65318  67756  2439  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  YP_003150464  normal  0.0942837  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00500  CDS  NC_013170  67772  68392  621  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150465  normal  0.791376  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00510  CDS  NC_013170  68394  69257  864  DMSO reductase anchor subunit  YP_003150466  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00520  CDS  NC_013170  69503  70141  639  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  YP_003150467  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00530  CDS  NC_013170  70166  71218  1053  DMSO reductase anchor subunit  YP_003150468  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00540  CDS  NC_013170  71345  71599  255  hypothetical protein  YP_003150469  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00550  CDS  NC_013170  71620  71826  207  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  YP_003150470  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00560  CDS  NC_013170  71916  73061  1146  hypothetical protein  YP_003150471  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00570  CDS  NC_013170  73466  74122  657  transcriptional regulator, tetR family  YP_003150472  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00580  CDS  NC_013170  74347  75780  1434  predicted Fe-S oxidoreductase  YP_003150473  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00590  CDS  NC_013170  75946  76977  1032  predicted phosphohydrolase  YP_003150474  normal  0.632945  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00600  CDS  NC_013170  77004  77408  405  hypothetical protein  YP_003150475  normal  0.263766  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00610  CDS  NC_013170  77571  77993  423  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  YP_003150476  normal  0.0616517  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00620  CDS  NC_013170  78181  79203  1023  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_003150477  hitchhiker  0.00293327  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00630  CDS  NC_013170  79236  79358  123  hypothetical protein  YP_003150478  decreased coverage  3.64486e-05  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00640  CDS  NC_013170  79357  79545  189  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  YP_003150479  decreased coverage  3.82755e-05  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00650  CDS  NC_013170  79917  81845  1929  chaperone protein DnaK  YP_003150480  normal  0.0257003  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00660  CDS  NC_013170  81851  82597  747  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  YP_003150481  normal  0.204562  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00670  CDS  NC_013170  82681  83646  966  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  YP_003150482  normal  0.772796  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00680  CDS  NC_013170  83643  84035  393  predicted transcriptional regulator  YP_003150483  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00690  CDS  NC_013170  84276  86891  2616  ATP-dependent chaperone ClpB  YP_003150484  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00700  CDS  NC_013170  87090  87560  471  deoxycytidylate deaminase  YP_003150485  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00710  CDS  NC_013170  87779  87916  138  hypothetical protein  YP_003150486  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00720  CDS  NC_013170  87926  89458  1533  Trk-type K+ transport system, membrane component  YP_003150487  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00730  CDS  NC_013170  89455  90078  624  hypothetical protein  YP_003150488  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00740  CDS  NC_013170  90087  91154  1068  predicted GTPase  YP_003150489  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00750  CDS  NC_013170  91315  92217  903  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  YP_003150490  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00760  CDS  NC_013170  92257  92814  558  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  YP_003150491  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00770  CDS  NC_013170  93173  96961  3789  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  YP_003150492  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00780  CDS  NC_013170  96961  99933  2973  hypothetical protein  YP_003150493  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00790  CDS  NC_013170  99959  100219  261  hypothetical protein  YP_003150494  normal  0.384358  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00800  CDS  NC_013170  100469  101128  660  hypothetical protein  YP_003150495  normal  0.438932  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00810  CDS  NC_013170  101455  102897  1443  Cna protein B-type domain-containing protein  YP_003150496  decreased coverage  0.00133256  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00820  CDS  NC_013170  103391  105685  2295  putative collagen-binding protein  YP_003150497  normal  0.0774638  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00830  CDS  NC_013170  105729  107177  1449  Cna protein B-type domain-containing protein  YP_003150498  normal  0.444591  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00840  CDS  NC_013170  107217  108140  924  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  YP_003150499  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00850  CDS  NC_013170  108365  109537  1173  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  YP_003150500  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00860  CDS  NC_013170  109555  110259  705  putative effector of murein hydrolase  YP_003150501  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00870  CDS  NC_013170  110277  111023  747  putative effector of murein hydrolase LrgA  YP_003150502  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00880  CDS  NC_013170  111360  111806  447  transcriptional regulator, MarR family  YP_003150503  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00890  CDS  NC_013170  112162  112545  384  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  YP_003150504  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00900  CDS  NC_013170  112580  112912  333  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  YP_003150505  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00910  CDS  NC_013170  113406  113939  534  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150506  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00920  CDS  NC_013170  114034  116247  2214  formate dehydrogenase alpha subunit  YP_003150507  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00930  CDS  NC_013170  116312  116911  600  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150508  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00940  CDS  NC_013170  116908  118926  2019  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  YP_003150509  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00950  CDS  NC_013170  118937  119866  930  formate hydrogenlyase subunit 4  YP_003150510  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00960  CDS  NC_013170  119882  121336  1455  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  YP_003150511  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00970  CDS  NC_013170  121346  121999  654  hydrogenase 4 membrane subunit  YP_003150512  normal  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00980  CDS  NC_013170  122010  123611  1602  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  YP_003150513  normal  0.558351  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00990  CDS  NC_013170  123620  125350  1731  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  YP_003150514  normal  0.823272  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01000  CDS  NC_013170  125351  125896  546  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  YP_003150515  normal  0.598496  normal  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>