More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00400 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  100 
 
 		 523 aa  1060    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  60.94 
 
 		 504 aa  614  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  54.45 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  48.3 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  46 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  45.8 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  45.98 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  45.8 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  45.8 
 
 		 479 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  45.8 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  45.8 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  45.6 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  46.79 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  46.96 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  45.97 
 
 		 480 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  45.86 
 
 		 470 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  46.96 
 
 		 466 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  44.6 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  44.17 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  43.96 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  43.71 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.34 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  42.91 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  42.54 
 
 		 476 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  42.34 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0830  amino acid carrier protein  43.95 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0296713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  44.69 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  43.8 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  44.29 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  44.08 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  42.46 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.77 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  43.35 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  43.88 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  43.88 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  43.88 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  43.95 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  43.65 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  44.49 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  44.58 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  44.58 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  44.27 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  44.58 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  41.9 
 
 		 480 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  44.58 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  44.58 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  45.57 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  40.76 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  45.57 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  42.8 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  44.26 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  41.87 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  43.67 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  42.53 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  42.13 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  39.72 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  40.96 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  42.42 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  41.89 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  42.6 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  40.96 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  41.92 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  41.89 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  43.43 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  41.24 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  42.4 
 
 		 497 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  42.4 
 
 		 497 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  41.2 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  44.93 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  39.46 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  41.95 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  41.67 
 
 		 484 aa  356  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  40.24 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  41.7 
 
 		 477 aa  355  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  42.71 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  39.04 
 
 		 502 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  41.96 
 
 		 483 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  41.05 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  42.98 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  40.51 
 
 		 495 aa  350  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  39.33 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  42.65 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  40.12 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  40.81 
 
 		 485 aa  346  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  40.57 
 
 		 487 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  40.25 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  41.19 
 
 		 492 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  41.92 
 
 		 471 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  39.8 
 
 		 486 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  38.77 
 
 		 475 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19510  amino acid carrier protein  42.03 
 
 		 480 aa  342  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>