More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00130 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0013  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 2969 bp  1251    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0756826  normal  0.599313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0055  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 2969 bp  1251    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0373093 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00130  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 3022 bp  5991    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01560  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 		 2947 bp  1396    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.550873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0045  23S ribosomal RNA  89.84 
 
 		 2935 bp  718    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.303465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08390  23S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 2947 bp  1404    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02360  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 3022 bp  5991    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0038  23S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 2969 bp  1251    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.620142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08950  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 3022 bp  5991    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  82.93 
 
 		 3027 bp  543  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  82.93 
 
 		 3027 bp  543  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2961 bp  535  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  86.64 
 
 		 3116 bp  420  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 3105 bp  420  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 3105 bp  420  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0004  23S ribosomal RNA  85.24 
 
 		 3007 bp  416  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0015  23S ribosomal RNA  85.24 
 
 		 3007 bp  416  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0023  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 3109 bp  412  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0016  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 3109 bp  412  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2897 bp  412  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2897 bp  412  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2897 bp  412  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2898 bp  412  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2897 bp  412  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0029  23S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 3109 bp  412  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655069  decreased coverage  0.000196644 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  85.2 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  85.2 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  85.2 
 
 		 2861 bp  402  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0043  23S ribosomal RNA  88.44 
 
 		 2993 bp  392  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0023  23S ribosomal RNA  85.66 
 
 		 2997 bp  391  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0022  23S ribosomal RNA  88.44 
 
 		 2993 bp  392  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.851566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 2908 bp  389  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0040  23S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 2883 bp  385  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2958 bp  383  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2909 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2909 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2926 bp  381  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2851 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2912 bp  381  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2912 bp  381  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2912 bp  381  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2911 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2912 bp  381  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2983 bp  383  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2983 bp  383  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0082  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0010  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2907 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0115  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.18423  hitchhiker  0.000445098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0110  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0124  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.303043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2907 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0121  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0442747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0103  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2893 bp  383  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0608054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2907 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2908 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  86.06 
 
 		 2907 bp  381  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>