135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0044  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0022  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0041  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0028  tRNA-Met  97.67 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0053  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3233  tRNA-Met  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0022  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0004  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0046  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0016  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0002  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0003  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0503535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0002  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0004  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0024  tRNA-Phe  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.117036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0005  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0007  tRNA-Met  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0020  tRNA-Met  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126987  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0060  tRNA-Met  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000113693  hitchhiker  0.00181269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0044  tRNA-Met  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00354252  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0085  tRNA-Met  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>