115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2617 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  140  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  67.35 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  61.22 
 
 		 341 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  62.5 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  55.32 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  65.85 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  54.17 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  54.17 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  54.17 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  51.11 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  51.11 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  53.33 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  53.33 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  51.11 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  51.02 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  52.08 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0988  IS1327 transposase  50 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 		 319 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  52.08 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  52.08 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  51.11 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  50 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  50 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  52.08 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  60 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  47.92 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  51.11 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  52.27 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  50 
 
 		 185 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  48.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  50 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  50 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  46.67 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  46.67 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  51.11 
 
 		 206 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  45.28 
 
 		 264 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  45.28 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  45.28 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  47.92 
 
 		 250 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  50 
 
 		 224 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  47.92 
 
 		 346 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  43.14 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  51.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  47.92 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  46.67 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  43.14 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  48.89 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  48.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  48.89 
 
 		 262 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  45.1 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  47.92 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  46.67 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  51.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  51.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  44.44 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  44.44 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  44.44 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  47.83 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  58.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  43.14 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  48.89 
 
 		 228 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  46.81 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  50 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  50 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  42.59 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  47.73 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  47.73 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  51.28 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  51.28 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  51.28 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  51.28 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>